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Análisis de genoma de Xylella fastidiosa en Italia, muestra relación con aislamientos de Centroamérica

Usuario Sábado, 1 de Julio de 2017 Artículos Científicos

Los estudios genéticos han demostrado que el genotipo bacteriano recuperado de olivos infectados pertenece a la secuencia tipo ST53 dentro de la subespecie pauca. Este genotipo, ST53, también se ha reportado en Costa Rica. La ascendencia de ST53 se aclaró recientemente, mostrando que contiene alelos que son monofiléticos con los de subsp. pauca en América del Sur. Para determinar de forma más robusta la colocación filogenética de ST53 dentro de X. fastidiosa, se realizó un análisis comparativo basado en polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) y el estudio del pan-genoma de las 27 secuencias del genoma completo de X. fastidiosa. Los árboles resultantes de máxima parsimonia y máxima verosimilitud construidos utilizando los SNPs y el análisis de pan-genoma son consistentes con la taxonomía de X. fastidiosa descrita anteriormente, distinguiendo el subsp. fastidiosa, multiplex, pauca, sandyi y morus. Dentro del subsp. pauca, el italiano y tres aislamientos costarricenses, todos pertenecientes al ST53, formaron un filotipo compacto en un clado divergente de los aislados de pauca de América del Sur, también distinto del aislado de café CFBP8072 importado recientemente en Europa desde Ecuador.

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